Litkevich Yuriy, по симптомам больше похоже на вирусяку.
Если поймал вирус и переустанавливаешь систему нужно поступать только так:
1. Отформатировать все под чистую и ставить свеженькую систему.
2. Если первое не подходит, то на второй том (диск D, если нет, то нужно создать) перенести все что тебе нужно, после чего первый том отформатировать в чистую и поставить на него систему. После чего до того как не то что прикасаться, а и смотреть второй том, желательно его проверить разными антивирями и выкорчевать эту дрянь. Как показывает практика её будет просто уйма. А потому только смотреть и пользовать его.
3. Поставить линуксу и не парится.

я сделал вообще просто:
оставил в системе один винт (остальные физически отрубил), форматнул, поставил хрюнделя и свежий Nod32, потом отрубил автозапуск "на всех дисках" (код 0xFF кажется). подключал винты по одному и проверял антивирем. Он ничего не нашёл. (это меня не удивило, т.к. перед переустановкой, я обе старые системы сканил несколькими анитивирусами, чуть-чуть нашлось, но поведение системы не изменилось)

Потом поставил драйвер сетевухи и брандмауэр.

П.С.
из двухтонника диск с хрюнделем не видно (только в "управлении дисками") и наоборот, делал так специально.

почему подумалось на фрагментацию памяти:
если запустить ворд, оперу и что-то ещё и не открывать в них документов, при этом работать в креаторе, то переключение между окнами ни когда не тормозит.

Если же работать как обычно. Т.е. то такой документ открыть, то эдакий, то закрывать какие-то документы. Тогда проявляется проблема с подвисанием.

авторан я не осилил с налёту ) Но сильно сомневаюсь, что IDE не умеют - ведь этот способ я встречал на IDE-шных винтах, когда лечил чужие машины

А в системных журналов сообщений об ошибке или всплывающих окнах и т.п нет?

своп задан ? Если есть, то можно попробовать перебросить на другой диск. Сделать его фиксированного размера. А насчет ide и авторана, ошибочка. Авторану, точнее винде вообше плевать на тип носителя.

да, к стати, есть, блин. И я уже всю голову сломал
Источник: disk
Появилось впервые полгода назад, но за лето частота событий возросла значительно (5...6 событий за сутки)
не могу понять что такое \Device\Harddisk3\D, если просто диск с меткой "D", то в общем-то это самый старый винт у меня. На нём лежат только данные, больше ни чего. Правда это не целый диск, а раздел. на другом разделе этого же винта стоит двухтонник

у меня два свопа, один на системном диске (тот, что по умолчанию создаётся), а второй на отдельном диске в отдельном разделе, размеры у обоих фиксированные.